Malgré ces succès dans le Dénouage des mécanismes moléculaires de l`induction d`IBD chez la souris, il est important de se rappeler que presque toutes les études de l`IBD de souris sont effectuées dans le contexte de la suppression complète d`un gène, un colitogène chimique fort, un fortement contrôlé et un environnement microbien uniforme et, dans de nombreux cas, une combinaison de ces trois facteurs non physiologiques. L`IBD humaine n`implique pas de telles perturbations génétiques et environnementales fortes, et ces systèmes peuvent donc ou non être des modèles appropriés pour des composants particuliers de la maladie humaine. Récemment, un modèle de souris de la mutation T300A dans le gène de l`autophagie ATG16L1 a montré un dégagement défectueux du pathogène iléal Yersinia enterocolitica et une réponse inflammatoire prolongée de cytokine (Lassen et al., 2014; Murthy et coll., 2014). L`utilisation future de modèles de souris qui reproduisent des altérations génétiques humaines précises découvertes à partir d`études d`association à l`échelle du génome de l`EIA dans le contexte des altérations pertinentes de l`IBD dans le microbiote sera une étape importante dans la modélisation de l`EIA humaine. Les voies affectées par les allèles de risque (ou de protection) d`EIA semblent parfois agir en synergie les unes avec les autres de telle sorte que deux processus (par exemple, l`autophagie et le stress du réticulum endoplasmique) fonctionnant dans le même type de cellule entraînent un environnement qui favorise Maladie. Inversement, la même voie peut affecter différents mécanismes dans des types cellulaires distincts conduisant au développement de la maladie. Par exemple, les défauts d`autophagie dans les cellules épithéliales conduisent à une altération de la fonction cellulaire de Paneth alors qu`un défaut autophagie similaire dans les macrophages altère la sécrétion d`IL-1 β, entraînant un milieu qui favorise le développement de l`EIA. En outre, la synergie peut être entre un «premier coup» représenté par un défaut dans une voie et un «second coup» d`un déclencheur microbien. Les variantes dans le locus HNF4A ont constamment démontré des associations fortes et spécifiques UC, qui avec les variantes CDH1, suggèrent un rôle clé pour l`intégrité de la barrière épithéliale dans la pathogenèse de l`UC. Plusieurs variantes génétiques au sein du complexe d`antigènes des leucocytes humains sur le chromosome 6p21 ont été fortement associées à l`UC. L`Association la plus cohérente avec un risque accru d`EIA est l`allèle DRB1 * 01:03, qui est associé plus fortement à l`UC que le CD, alors que l`allèle DRB1 * 04:01 se trouve moins couramment dans l`UC (Jostins et al., 2012). Ces variations influent sur la reconnaissance microbienne au niveau de la présentation de l`antigène, et sont des indices de l`implication du microbiote dans l`EIA. Le potentiel du microbiome intestinal en tant que biomarqueur candidat pour la santé de l`hôte dans l`IBD n`a pas encore été pleinement exploré.
En tant qu`indicateur diagnostique transversal pour l`EIA, les profils microbiens du côlon ne fournissent qu`une faible délimitation entre les patients et les témoins asymptomatiques (Dicksved et al., 2008; Frank et coll., 2007; Morgan et coll., 2012), en excluant une «balle magique» simple et universelle pour un diagnostic précoce, bien qu`optimiste, ce n`est pas le cas dans toutes les conditions inflammatoires complexes. Au lieu de cela, l`hétérogénéité entre les CD, les UC et les sous-types en leur sein (p. ex., CD iléal) suggère que des échantillons microbiens choisis avec soin pourraient, par exemple, être utilisés pour améliorer la classification dans des conditions à haut risque comme la chirurgie de la poche iléale (Tyler et coll., 2013). Miguel Regueiro, MD, gastroentérologue et co-directeur de la maison de médecine spécialisée de Total Care-IBD à l`UPMC, prévoit un jour où les soins intégrés de haute-touche pour les patients diagnostiqués avec IBD devient standard. Les prestataires doivent donc se préparer. Certains plans de santé s`intensifient pour soutenir la nouvelle approche de soins. Grâce à son contrat de «maison médicale intensive», Blue Cross et Blue et Shield of Illinois paient un IGG par membre, par mois pour soutenir le modèle de prestation des soins intensifs en main-d`œuvre. Après un pilote réussi, l`assureur a commencé à encourager les pratiques de gastroentérologie dans tout l`État pour suivre l`exemple.